那曲檬骨新材料有限公司

您好,歡迎來電子發(fā)燒友網(wǎng)! ,新用戶?[免費注冊]

您的位置:電子發(fā)燒友網(wǎng)>源碼下載>數(shù)值算法/人工智能>

讀分割最優(yōu)匹配的indels識別算法

大小:0.83 MB 人氣: 2017-12-25 需要積分:3

  高通量測序技術(shù)的發(fā)展,極大地推動了基因組結(jié)構(gòu)變異識別的研究,當(dāng)前,該領(lǐng)域主要使用覆蓋度、讀分割或片段組裝方法來識別變異,但目前的方法識別結(jié)果不夠準(zhǔn)確,敏感度高,對基因組結(jié)構(gòu)變異的信息(如變異序列、變異坐標(biāo)等)挖掘不充分.插入和刪除類型的結(jié)構(gòu)變異統(tǒng)稱為indels,在基因組結(jié)構(gòu)變異中最為常見.為此,針對indels的精確識別,提出了基于讀分割和動態(tài)規(guī)劃的最優(yōu)序列匹配算法(optimal split-read matching algorithm,簡稱OSRM).OSRM算法能將異常讀片段以最少的空位打斷比對到參考序列上.首先建立異常讀片段與特定參考序列的匹配得分矩陣;然后,建立回溯路徑矩陣;最后,用以變異特點設(shè)計的得分公式對每條路徑進(jìn)行最優(yōu)匹配篩選,輸出精確識別的indels坐標(biāo)及序列.實驗結(jié)果顯示。該方法對小中型的indels有很高的識別性能.此外,與讀分割法的經(jīng)典算法Pindel進(jìn)行了比較,證買OSRM算法在小中型的indels識別方面有更好的效果,可識別更復(fù)雜的情況.

讀分割最優(yōu)匹配的indels識別算法

非常好我支持^.^

(0) 0%

不好我反對

(0) 0%

      發(fā)表評論

      用戶評論
      評價:好評中評差評

      發(fā)表評論,獲取積分! 請遵守相關(guān)規(guī)定!

      ?
      大发888真坑阿| 大发888合营商| 百家乐官网玩法规| 明升论坛| 百家乐视频百家乐| 百家乐官网天下第一缆| 威尼斯人娱乐代理注册| 百家乐官网网上真钱赌场娱乐网规则| 六合彩印刷图库| 百家乐全程打庄| 百家乐官网洗码全讯网| 大发888娱乐英皇国际| 百家乐赌场代理荐| 百家乐官网群必胜打朽法| 菲律宾百家乐官网的说法| bet365娱乐平台| 威尼斯人娱乐城是波音| 太阳城百家乐红利| 大发888资讯网| 百家乐赌场程序| 百家乐官网77scs官| 至尊百家乐官网20130201| 曲阜市| 德州扑克的玩法| 新时代百家乐的玩法技巧和规则| 半圆百家乐桌子| 百家乐是否有规律| 澳门百家乐官网玩法与游戏规则| 皇冠开户网址| 尚品棋牌注册| 德州扑克与梭哈| 太阳城线上娱乐城| 威尼斯人娱乐网开户| 百家乐统计工具| 百家乐官网追号软件| 太原百家乐官网招聘| 新全讯网777| 克拉克百家乐的玩法技巧和规则| 娱乐城百家乐可以代理吗 | 百家乐预测神法| 百家乐庄闲比率|