德睿智藥是一家運用AI技術驅動藥物研發的科技公司,其自研的一站式AI藥物研發平臺Molecule Pro、分子動力學平臺MoleculeDance可為小分子藥物臨床前開發大幅節省研發時間及成本。德睿智藥的部分AI解決方案是通過使用NVIDIA A100 GPU實現的,德睿團隊的研發效率也得以大幅提升。
GPU提速算法訓練速度數十倍以上
目前針對難成藥靶點的相關技術正處于突破的臨界點,人工智能技術為加速創新藥物及難成藥靶點的藥物開發帶來了新的可能。例如AlphaFold2通過人工智能從一維序列信息推演蛋白質的三維結構證明了人工智能等相關算法可以攻克傳統技術難以解決的問題。
德睿智藥自主研發的Molecule Pro平臺中AI分子生成,虛擬篩選和分子動力學等相關技術需要強勁的算力支持。使用普通的主流顯卡進行一次模擬往往需要長達一周的時間,但通過NVIDIA A100 Tensor Core GPU搭建高性能分布式計算平臺,不僅可以快速處理數十億級別海量藥物化學信息,而且借助其強大算力,相關模型訓練速度可以提升10倍以上。
為了更大限度地利用GPU算力資源,德睿團隊使用多臺GPU服務器組成集群,用Kubernetes配合NVIDIA-docker實現容器化模型的彈性編排和資源分配,把任務動態分散到多臺服務器上,利用A100 GPU的強大算力和超大顯存實現大規模并行計算,大大縮短了原本計算所需時間。
采用算法結合NVIDIA A100 GPU平臺可以從億量級化合物庫、蛋白質庫及結合數據庫中快速尋找出潛在規律。同樣價格的硬件環境下,團隊通過該平臺流程進行計算的速度比傳統流程快60%以上。
助力企業大幅提升藥物開發效率
新藥研發是一項環節多、時間長、風險高的系統性工程。早期藥物發現花銷占新藥研發成本和綜合周期的1/3,且大部分臨床階段的失敗源自于臨床前分子設計的缺陷。德睿智藥團隊將以此為切入點,依托AI輔助藥物研發技術,借助NVIDIA GPU的加速,致力于打造領先的AI生物醫藥引擎,聚焦臨床前藥物研發。
德睿智藥創始人兼CEO牛張明表示,“我們高興地看到:通過使用NVIDIA A100 GPU讓我們在AI分子設計/生成、虛擬篩選、分子動力學模擬等任務上效率大大提高。”
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原文標題:初創加速 | GPU助力德睿智藥加速創新藥物研發
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