體外生物學(xué)模型對(duì)于廣泛的生物醫(yī)學(xué)研究至關(guān)重要,包括藥物開發(fā)、病理學(xué)研究和個(gè)性化醫(yī)療。作為體外3D生物模型的潛在變革范例,器官芯片(OOC)已得到廣泛開發(fā)。OOC的關(guān)鍵功能是支持對(duì)活體組織及其微環(huán)境進(jìn)行多方面的及時(shí)分析,因此智能OOC系統(tǒng)受到了越來越多的關(guān)注。
近日,來自加拿大多倫多大學(xué)的Xinyu Liu聯(lián)合西安交通大學(xué)的Jiankang He探討了智能OOC(iOOC)系統(tǒng)的最新進(jìn)展,并對(duì)促進(jìn)iOOC系統(tǒng)興起的原位傳感系統(tǒng)、數(shù)據(jù)處理方法和動(dòng)態(tài)調(diào)制組件進(jìn)行了全面分析。此外,該綜述對(duì)iOOC系統(tǒng)組件的潛在機(jī)制、技術(shù)和應(yīng)用進(jìn)行了調(diào)研。當(dāng)與iOOC系統(tǒng)中的數(shù)據(jù)處理技術(shù)和動(dòng)態(tài)調(diào)制組件相結(jié)合時(shí),來自集成傳感器的數(shù)據(jù)流可以形成一個(gè)閉環(huán),用于精確控制iOOC模型,并可以促進(jìn)深入的生物醫(yī)學(xué)發(fā)現(xiàn)(例如,用于優(yōu)化藥物劑量的藥代動(dòng)力學(xué)/藥效學(xué)研究)。因此,iOOC系統(tǒng)具有成為各種生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用中可靠和有效的工具的巨大潛力。相關(guān)綜述論文以“Advancing Intelligent Organs-on-a-Chip Systems with Comprehensive in situ Bioanalysis”為題發(fā)表在Advanced Materials期刊上。
圖1 iOOC系統(tǒng)示意圖
OOC向iOOC系統(tǒng)的演進(jìn)
OOC技術(shù)已得到廣泛開發(fā),以解決傳統(tǒng)2D細(xì)胞培養(yǎng)的局限性,例如無(wú)法構(gòu)建異質(zhì)細(xì)胞群和細(xì)胞外基質(zhì)環(huán)境的3D組織特異性結(jié)構(gòu)。OOC技術(shù)源于微流控與組織工程的融合(圖2)。雖然組織工程的最初目標(biāo)是再生人體組織,但該技術(shù)已經(jīng)產(chǎn)生了各種構(gòu)建3D組織結(jié)構(gòu)的方法,這些結(jié)構(gòu)可能由細(xì)胞外基質(zhì)材料、支架結(jié)構(gòu)以及各種細(xì)胞的預(yù)定義組成和排列組成。設(shè)計(jì)OOC的主要范式是重建特定組織的組成和微環(huán)境的關(guān)鍵方面,微流控和組織工程技術(shù)為OOC的發(fā)展帶來了三個(gè)關(guān)鍵優(yōu)勢(shì)。
由于傳感器和OOC之間的集成,智能OOC(iOOC)系統(tǒng)將興起:不同的傳感單元不斷報(bào)告OOC模型的狀況,并使用詢問模型的算法處理數(shù)據(jù)流或使用OOC中的有源組件對(duì)其進(jìn)行調(diào)制。iOOC系統(tǒng)可以建立更可控、更準(zhǔn)確、更可靠的體外模型,并可以加深對(duì)生理和病理活動(dòng)的理解。
圖2 器官芯片系統(tǒng)的演變
iOOC系統(tǒng)的原位傳感
與iOOC系統(tǒng)集成的各種傳感單元收集關(guān)鍵的生物信息并生成為智能功能奠定基礎(chǔ)的數(shù)據(jù)流。在該論文中,作者概述了將傳感單元集成到iOOC系統(tǒng)中的技術(shù),然后分析傳感單元的集成方法。
(1)iOOC系統(tǒng)的傳感技術(shù)
已經(jīng)建立了許多方法將細(xì)胞和微環(huán)境的屬性轉(zhuǎn)換為可以用電路輕松處理的電信號(hào)。此部分,主要總結(jié)了基于電生理信號(hào)記錄以及電阻和阻抗測(cè)量的iOOC系統(tǒng)的原位電傳感技術(shù)(圖3A)。電化學(xué)生物傳感器將與電化學(xué)反應(yīng)相關(guān)的生物信息轉(zhuǎn)化為可測(cè)量的電信號(hào),例如電導(dǎo)、電阻和電極表面電容的變化(圖3B)。一般來說,電化學(xué)生物傳感機(jī)制提供高特異性、寬動(dòng)態(tài)范圍、易于定量的電輸出以及方便的集成。它們通常適用于檢測(cè)指向多種信息的分子生物標(biāo)志物。特別是,集成在器官芯片上的電化學(xué)生物傳感器可以以多重方式檢測(cè)多種生物標(biāo)志物。此外,還有iOOC系統(tǒng)的光學(xué)傳感技術(shù)、機(jī)械傳感技術(shù)均對(duì)其進(jìn)行了詳細(xì)說明。
圖3iOOC系統(tǒng)生物傳感的電傳感機(jī)制
(2)將傳感器集成到iOOC系統(tǒng)中的策略
傳感單元應(yīng)與iOOC系統(tǒng)無(wú)縫集成,以持續(xù)生成支撐系統(tǒng)智能的有價(jià)值的數(shù)據(jù)。為了實(shí)現(xiàn)高性能監(jiān)測(cè),傳感機(jī)制應(yīng)與目標(biāo)相匹配,并且傳感器的功能在微流控、動(dòng)態(tài)和組織涉及的微環(huán)境中應(yīng)具有魯棒性,因?yàn)榭赡艽嬖谧枘嵝?yīng)、改變離子分布和其他干擾。
人們提出了多種策略將傳感單元集成到iOOC系統(tǒng)中。主要有:(i)與組織直接結(jié)合:傳感結(jié)構(gòu)可以與體外活組織或類器官建立接觸和整合,以連續(xù)記錄反映這些模型生理狀態(tài)的各種數(shù)據(jù)。作者總結(jié)了生物傳感單元與活體組織集成的形式,包括離散探針、2D接觸、3D包裹和3D嵌入(圖4、圖5)。(ii)其他整合策略:傳感單元可以放置在微流控環(huán)境中,而無(wú)需直接接觸組織,一種典型的方法是將傳感單元合并到微流控通道或室中以監(jiān)測(cè)培養(yǎng)基的狀況;此外,傳感單元可以制成可移動(dòng)的以探測(cè)局部組織或培養(yǎng)基。
圖4 2D接觸和3D包裹形式的傳感器-組織集成
圖5 3D嵌入形式的組織傳感器集成
(3)在iOOC系統(tǒng)中感測(cè)多模態(tài)信息
iOOC系統(tǒng)中的組織模型構(gòu)成了對(duì)生物醫(yī)學(xué)有價(jià)值的復(fù)雜細(xì)胞信息的中心。在該論文中,作者總結(jié)并討論了有關(guān)生物標(biāo)志物、細(xì)胞-細(xì)胞連接、生物電活動(dòng)和生物力學(xué)活動(dòng)的細(xì)胞信息的解釋。
細(xì)胞培養(yǎng)微環(huán)境的準(zhǔn)確監(jiān)測(cè)和控制對(duì)于體外生物模型的成功至關(guān)重要,因?yàn)槲h(huán)境的變化會(huì)影響細(xì)胞的代謝和功能表達(dá)。為了在體外盡可能準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)體內(nèi)細(xì)胞或組織的反應(yīng),需要在iOOC系統(tǒng)中監(jiān)測(cè)氧含量、pH值和溫度等各種微環(huán)境信息。
iOOC系統(tǒng)的數(shù)據(jù)處理
iOOC系統(tǒng)中數(shù)據(jù)處理技術(shù)的作用可以從兩個(gè)方面來考慮。首先,數(shù)據(jù)處理可用于調(diào)整iOOC系統(tǒng)中的驅(qū)動(dòng)部件,以確保精確調(diào)制并使系統(tǒng)更加自動(dòng)化。其次,數(shù)據(jù)處理可以帶來對(duì)發(fā)育、生理和病理過程的更多生物醫(yī)學(xué)見解。在該論文中,作者介紹了可用于處理iOOC系統(tǒng)生物分析數(shù)據(jù)的方法,包括圖像分析、傳感數(shù)據(jù)解釋、自動(dòng)化和數(shù)值模擬。
(1)iOOC系統(tǒng)的數(shù)據(jù)處理技術(shù)
作為人工智能和計(jì)算機(jī)科學(xué)的重要課題,機(jī)器學(xué)習(xí)算法直接從數(shù)據(jù)中解釋信息,而不依賴于預(yù)定模型(例如指定的標(biāo)準(zhǔn)和校準(zhǔn)曲線),通常用于分類、回歸和聚類等工作(圖6A ~ 6D)。分類本質(zhì)上是將數(shù)據(jù)點(diǎn)分配給離散類別,回歸生成連續(xù)值作為輸出,聚類本質(zhì)上預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)集中相似數(shù)據(jù)點(diǎn)的分組。這些算法隨著數(shù)據(jù)量的增加而提高其性能。
圖6iOOC系統(tǒng)的數(shù)據(jù)處理技術(shù)
(2)iOOC系統(tǒng)的數(shù)值模擬技術(shù)
可以采用有限元法、格子玻爾茲曼法、平滑粒子流體動(dòng)力學(xué)等數(shù)值模擬技術(shù)來深入了解iOOC系統(tǒng)的物理和化學(xué)環(huán)境。數(shù)值模擬技術(shù)有助于消除重復(fù)實(shí)驗(yàn)測(cè)量(例如剪切應(yīng)力和氧氣分布)的需要,并允許以較低的成本優(yōu)化iOOC系統(tǒng)。此外,這些技術(shù)可以提高對(duì)iOOC系統(tǒng)微環(huán)境中物理現(xiàn)象和組織行為的理解。
(3)iOOC系統(tǒng)的閉環(huán)控制技術(shù)
為了實(shí)現(xiàn)更高水平的質(zhì)量控制并準(zhǔn)確調(diào)整iOOC系統(tǒng)中的模型條件,可以利用依賴于傳感器數(shù)據(jù)流的閉環(huán)控制(也稱為反饋控制)技術(shù)。在工程設(shè)備廣泛采用的閉環(huán)控制系統(tǒng)中,測(cè)量實(shí)際輸出信號(hào)并將其與所需輸出信號(hào)進(jìn)行比較,以計(jì)算誤差項(xiàng),該誤差項(xiàng)用于生成調(diào)整輸入的控制信號(hào)(圖6E)。
iOOC系統(tǒng)的動(dòng)態(tài)調(diào)制
生物組織對(duì)其微環(huán)境中的各種外部刺激敏感,越來越多的研究證明,各種細(xì)胞-細(xì)胞外基質(zhì)(ECM)和細(xì)胞-細(xì)胞相互作用可以導(dǎo)致廣泛的組織特異性表型。iOOC系統(tǒng)為加深對(duì)這種復(fù)雜相互作用的理解提供了新的機(jī)會(huì),因?yàn)榭梢圆渴鸺傻竭@些系統(tǒng)中的調(diào)節(jié)組件來控制微環(huán)境并調(diào)整組織模型以代表生理和病理?xiàng)l件。iOOC系統(tǒng)中的某些組件可以執(zhí)行傳感和調(diào)制的綜合功能,支持iOOC模型的雙向原位表征,以揭示更深入的生物醫(yī)學(xué)見解。
(1)iOOC系統(tǒng)的機(jī)械載荷:在具有動(dòng)態(tài)細(xì)胞培養(yǎng)環(huán)境的OCC系統(tǒng)中應(yīng)用機(jī)械載荷對(duì)于在體外建立類組織的生理微環(huán)境至關(guān)重要。為了產(chǎn)生動(dòng)態(tài)拉伸和壓縮,通常需要專門的機(jī)械結(jié)構(gòu)和驅(qū)動(dòng)機(jī)制,而在OOC中可以通過控制流體動(dòng)力學(xué)來精確調(diào)節(jié)剪切應(yīng)力(圖7)。
圖7 iOOC系統(tǒng)中的機(jī)械調(diào)制原理圖
(2)iOOC系統(tǒng)的電刺激:多種細(xì)胞行為受到內(nèi)源電流和電位的調(diào)節(jié),因此iOOC系統(tǒng)中經(jīng)常需要電刺激。為了產(chǎn)生特定目的的可控電刺激,需要仔細(xì)配置相應(yīng)的電元件。許多結(jié)合電刺激的OOC設(shè)備被設(shè)計(jì)用于研究肌肉、心臟和神經(jīng)系統(tǒng)(圖8A)。
圖8 iOOC系統(tǒng)中的電氣和化學(xué)調(diào)制原理圖
(3)iOOC系統(tǒng)的化學(xué)處理:準(zhǔn)確的體外生理模型通常需要時(shí)間和空間可控的化學(xué)環(huán)境。通過微流控技術(shù),可以在整個(gè)裝置的可調(diào)節(jié)流體流量?jī)?nèi)精確控制化學(xué)相互作用和分布,以匹配與細(xì)胞成分相同的規(guī)模。微流控裝置中可以使用化學(xué)信號(hào)發(fā)生器,向細(xì)胞引入隨時(shí)間變化的化學(xué)信號(hào),以便研究組織對(duì)動(dòng)態(tài)變化的化學(xué)信號(hào)的反應(yīng)(圖8B)。
未來展望
(1)傳感單元
iOOC系統(tǒng)中生物傳感單元的未來發(fā)展可以充分利用生物傳感器和生物電子學(xué)領(lǐng)域的新興技術(shù)和策略。在傳感材料和制造方法方面研究進(jìn)展的推動(dòng)下,生物傳感器和生物電子學(xué)正在獲得越來越強(qiáng)大的能力,例如高靈敏度、高小型化以及與活體組織改善的機(jī)械相容性。因此,它們更適合集成到iOOC系統(tǒng)中。
(2)數(shù)據(jù)處理
隨著iOOC系統(tǒng)的不斷發(fā)展,將培養(yǎng)、維護(hù)、監(jiān)測(cè)和調(diào)節(jié)各種各樣的組織模型,這將構(gòu)成有價(jià)值的生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)的重要來源。例如,iOOC系統(tǒng)可以形成具有不同細(xì)胞組成和微環(huán)境的組織模型以模擬特定疾病狀況,并且iOOC系統(tǒng)可以支持對(duì)組織模型的不同區(qū)域進(jìn)行各種連續(xù)生物分析以檢測(cè)空間異質(zhì)性。此外,iOOC系統(tǒng)的多模態(tài)傳感數(shù)據(jù)可以與組織模型的多組學(xué)數(shù)據(jù)相關(guān)聯(lián),以對(duì)生物機(jī)制產(chǎn)生更深入、更全面的理解。
(3)調(diào)節(jié)單元
iOOC系統(tǒng)中的調(diào)節(jié)單元可以通過利用技術(shù)發(fā)展和生物醫(yī)學(xué)研究的進(jìn)步來尋求更深入的組織整合和更有效的擾動(dòng),如軟生物電子元件、新型微米和納米級(jí)結(jié)構(gòu)等。
(4)智能芯片人系統(tǒng)
連接不同器官微型模型的人體芯片設(shè)備的出現(xiàn),為研究人體器官的復(fù)雜相互作用和獲得對(duì)生理學(xué)和病理學(xué)的系統(tǒng)見解提供了可能性。當(dāng)iOOC系統(tǒng)集成人體芯片模型時(shí),由多個(gè)傳感器支持的原位生物分析可以增強(qiáng)這些模型充分發(fā)揮其潛力。
(5)iOOC系統(tǒng)的標(biāo)準(zhǔn)化
質(zhì)量控制已被OOC技術(shù)研發(fā)界視為一項(xiàng)關(guān)鍵任務(wù),非常需要OOC的標(biāo)準(zhǔn)化,以對(duì)臨床實(shí)踐和制藥行業(yè)產(chǎn)生重大影響iOOC系統(tǒng)的發(fā)展可能會(huì)對(duì)標(biāo)準(zhǔn)化產(chǎn)生多方面的影響。
審核編輯:劉清
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原文標(biāo)題:綜述:智能器官芯片系統(tǒng)在原位生物分析中的應(yīng)用
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